メールを選択してツールバーの「削除」ボタンを押すと、削除確認のダイアログが表示されます。「はい」を選択するとメールをゴミ箱へ入れます。

また、メール一覧からも「削除」が行えます。
メール一覧のメールの上で右クリックをして、メニューから「削除 Del」を選択することでメールの削除を行います。